значит, столкнулся тоже с этой проблемой, вот мое решение: для начала у меня не хотела заводится прозрозрачность водяного знака, для этого я изменил библиотеку работы с изображениями с imagegick на gd
[images]
;Использовать imagemagick для обработки изображений (вместо gd)
use_imagick = false;
следующий шаг: Открываем файл api/Image.php прошерстив код - увидел, и в самом деле watermark добавляется после ресайза, значит нужно чтото делать, а именно: поскольку мы переключились на библиотеку gd значит нам нужен метод image_constrain_gd он находится у меня на строке 174 там ищем такой код: